Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DSG1Q02413 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms