Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ACTBP60709 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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