Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NESP48681 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NESP48681 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NESP48681 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 OLA1P2-201ENST00000395519 1264 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 CCL5-201ENST00000603197 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NESP48681 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 AC140847.2-201ENST00000545923 501 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NESP48681 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms