Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGAEP38570 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms