Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RBL1P28749 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RBL1P28749 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RBL1P28749 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms