Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
DUSP1P28562 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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