Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPREP23469 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PTPREP23469 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTPREP23469 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
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