Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FGFR3P22607 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms