Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ACTN1P12814 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms