Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
VPREB1P12018 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms