Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TOP2AP11388 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TOP2AP11388 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms