Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RALAP11233 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RALAP11233 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RALAP11233 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RALAP11233 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms