Protein–RNA interactions for Protein: P10747

CD28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD28P10747 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
CD28P10747 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
CD28P10747 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
CD28P10747 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms