Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
APODP05090 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
APODP05090 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
APODP05090 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms