Protein–RNA interactions for Protein: P02675

FGB, Fibrinogen beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGBP02675 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FGBP02675 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGBP02675 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGBP02675 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGBP02675 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGBP02675 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGBP02675 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FGBP02675 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FGBP02675 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FGBP02675 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms