Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
HLA-DQB1P01920 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC040174.1-201ENST00000563003 2571 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
HLA-DQB1P01920 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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