Protein–RNA interactions for Protein: O60759

CYTIP, Cytohesin-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTIPO60759 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CYTIPO60759 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms