Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
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HOXA3O43365 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
HOXA3O43365 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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