Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
TO15178 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
TO15178 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TO15178 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TO15178 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
TO15178 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TO15178 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
TO15178 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TO15178 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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