Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC023090.1-201ENST00000592906 502 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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