Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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