Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CCDC162PA2VCL2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms