Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
TRAPPC4Q9Y296 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms