Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GTF2IRD1Q9UHL9 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms