Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
PCSK1NQ9UHG2 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PCSK1NQ9UHG2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms