Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CGGBP1Q9UFW8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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