Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DKK3Q9UBP4 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms