Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
HOXC10Q9NYD6 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC10Q9NYD6 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC10Q9NYD6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC10Q9NYD6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC10Q9NYD6 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HOXC10Q9NYD6 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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