Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB6BQ9NRW1 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms