Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SEMA4BQ9NPR2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms