Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RAB18Q9NP72 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms