Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHACTR1Q9C0D0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHACTR1Q9C0D0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms