Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 KRT17P7-202ENST00000582261 2334 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ASB3-204ENST00000406687 2205 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 DDX11-223ENST00000542838 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 POU2F2-201ENST00000342301 3730 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMEM123-202ENST00000398136 3579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 SRRT-215ENST00000614484 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TMCC2-208ENST00000545499 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 UBR7-201ENST00000013070 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ABI1-212ENST00000490841 3188 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PCDHGA4-202ENST00000612927 2691 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PIGS-202ENST00000308360 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MVP-201ENST00000357402 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 CTNS-201ENST00000046640 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 AL135999.1-201ENST00000555968 3243 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 GRM7-201ENST00000357716 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SNHG12Q9BXW3 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms