Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NUP58Q9BVL2 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NUP58Q9BVL2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms