Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FYCO1Q9BQS8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms