Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LPIN3Q9BQK8 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms