Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TCF12Q99081 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms