Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.07
KCNC2Q96PR1 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
KCNC2Q96PR1 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms