Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG4Q92954 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG4Q92954 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms