Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TRIM41Q8WV44 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms