Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MYRIPQ8NFW9 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 TMUB2-215ENST00000592825 2151 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 PTPN5-203ENST00000396168 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MYRIPQ8NFW9 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms