Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RYBPQ8N488 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RYBPQ8N488 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms