Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWZ6

BBS7, Bardet-Biedl syndrome 7 protein, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS7Q8IWZ6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BBS7Q8IWZ6 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms