Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
KCNMB4Q86W47 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
KCNMB4Q86W47 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms