Protein–RNA interactions for Protein: Q6P435

Putative uncharacterized SMG1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6P435 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Q6P435 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q6P435 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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