Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HYLS1-202ENST00000425380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FP325332.1-201ENST00000624818 2045 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RERE-204ENST00000400908 5790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CPLX4-202ENST00000587244 1916 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 C14orf159-203ENST00000412671 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CASP3-206ENST00000523916 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GFI1B-201ENST00000339463 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ANKEF1-202ENST00000378392 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SLC25A17-217ENST00000544408 2060 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PYGM-201ENST00000164139 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 BCL11A-204ENST00000359629 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL356488.3-201ENST00000608574 2888 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 GDPD2-201ENST00000374382 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ANAPC7-203ENST00000455511 3045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 WTH3DI-201ENST00000623617 3032 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 CYB5R3-202ENST00000361740 2938 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
ANKRD39Q53RE8 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms