Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RFTN2Q52LD8 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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