Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI83

KRTAP24-1, Keratin-associated protein 24-1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP24-1Q3LI83 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
KRTAP24-1Q3LI83 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 418.7 ms