Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

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Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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AP5B1Q2VPB7 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AP5B1Q2VPB7 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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