Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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RTL8BQ17RB0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RTL8BQ17RB0 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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